Jména taxonů vyšších než rod jsou jednoslovná podstatná jména, píší se s velkým písmenem. Latinské jméno taxonu vychází z latinského jména rodu, ke kterému se připojuje koncovka, u základních taxonů pevně určená :

čeleď	-aceae
řád	-ales
třída	-opsida
pododdělení	-phytina
oddělení	-phyta

Jména druhů jsou dvouslovná, skládají se ze jména rodu (podstatné jméno, v češtině i latinsky) a druhového přívlastku (druhové epiteton), který je nejčastěji přídavným jménem, méně často jménem podstatným, například prha chlumní anebo prha arnika.

Taxony nižší než druh mají jméno nejméně tříslovné. Skládá se tak, že za druhové epiteton se připojí zkratka označující hodnotu taxonu a za ní epiteton příslušného taxonu, v češtině se zkratka taxonu vynechává (například Brassica oleracea var. botrytis, brukev zelná květák). Za vědecké jméno taxonu (latinské) se připojuje zkratka jména (nebo celé jméno) autora nebo autorů, který jméno vytvořil, použil a platně publikoval. Carl Linné, který popsal a pojmenoval většinu druhů se zkracuje na jedno písmeno. V případě přeřazení určitého druhu do jiného rodu nebo při jiné změně taxonomické hodnoty (například změna druhu v poddruh, poddruhu na druh) zůstává v platnosti druhové epiteton a jméno původního autora se dává do závorky. Příklad: druh koniklec luční Pulsatilla pratensis byl původně popsán a pojmenovám Linnéem jako sasanka luční Anemone pratensis L. Později tento druh přeřadil Miller do rodu koniklec Pulsatilla, proto se současné platné jméno píše v této podobě: koniklec luční, Pulsatilla pratensis (L.) Mill.

České jméno se píše obyčejně, s malým písmenem na začátku, latinské jméno (vědecké) se píše kurzívou, jméno rodu velkým písmenem na začátku, druhové jméno s malým písmenem a jméno nebo zkratka autora se píše obyčejně, často velkými písmeny. Například koniklec luční, Pulsatilla pratensis (L.) MILL.

Zásady vědeckého pojmenování taxonů jsou dané mezinárodními pravidly botanické nomenklatury, které jsou velmi podrobná a složitá.
 

Podle knihy R. Hendrych, Systém a evoluce vyšších rostlin